Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Plec-221ENSMUST00000171562 14944 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Plec-204ENSMUST00000072692 14944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Brip1os-202ENSMUST00000143819 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Col4a5-201ENSMUST00000112930 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Trp63-203ENSMUST00000115304 2634 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 4930568E12Rik-202ENSMUST00000216694 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Slc2a5-201ENSMUST00000030826 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms