Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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