Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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