Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf169E9Q7F2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf169E9Q7F2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms