Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccdc71lE9Q4T4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccdc71lE9Q4T4 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccdc71lE9Q4T4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccdc71lE9Q4T4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccdc71lE9Q4T4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccdc71lE9Q4T4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ccdc71lE9Q4T4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc71lE9Q4T4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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