Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms