Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf1B2RRD7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms