Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spocd1B1ASB6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms