Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Grik3B1AS29 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms