Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtf1A2AQ19 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms