Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Frmpd1A2AKB4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd1A2AKB4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms