Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms