Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Hdac6Q9Z2V5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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Hdac6Q9Z2V5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Hdac6Q9Z2V5 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Hdac6Q9Z2V5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Hdac6Q9Z2V5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Hdac6Q9Z2V5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Hdac6Q9Z2V5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Hdac6Q9Z2V5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Hdac6Q9Z2V5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Hdac6Q9Z2V5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac6Q9Z2V5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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