Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms