Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr4Q9Z1L2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms