Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Ccl8Q9Z121 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccl8Q9Z121 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccl8Q9Z121 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccl8Q9Z121 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccl8Q9Z121 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccl8Q9Z121 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccl8Q9Z121 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccl8Q9Z121 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccl8Q9Z121 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccl8Q9Z121 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccl8Q9Z121 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccl8Q9Z121 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl8Q9Z121 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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