Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms