Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms