Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms