Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms