Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms