Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim44Q9QXA7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms