Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms