Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrfQ9JM73 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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