Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CubnQ9JLB4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms