Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Prg3Q9JL95 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Prg3Q9JL95 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Prg3Q9JL95 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Prg3Q9JL95 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg3Q9JL95 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms