Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms