Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrpraQ9DBG7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms