Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms