Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc89Q9DA73 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms