Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ift43Q9DA69 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms