Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms