Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc105Q9D4K7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms