Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lonrf3Q9D4H7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms