Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Snx29Q9D3S3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Snx29Q9D3S3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Snx29Q9D3S3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx29Q9D3S3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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