Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms