Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2e1Q9D0D5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms