Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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