Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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