Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms