Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms