Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms