Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg3Q9CPX6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms