Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms