Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln4Q99NB8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ubqln4Q99NB8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ubqln4Q99NB8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ubqln4Q99NB8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ubqln4Q99NB8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubqln4Q99NB8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ubqln4Q99NB8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubqln4Q99NB8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ubqln4Q99NB8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubqln4Q99NB8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubqln4Q99NB8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubqln4Q99NB8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubqln4Q99NB8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubqln4Q99NB8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubqln4Q99NB8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ubqln4Q99NB8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms