Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms