Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gps1Q99LD4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gps1Q99LD4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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