Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hps4Q99KG7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms