Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms