Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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